Sur le territoire du SAGE Loire en Rhône-Alpes, plusieurs procédures globales de gestion de l’eau (contrats de rivière notamment) étaient déjà en place dès le début des années 2000, mettant en évidence les problématiques de ressources en eau et de milieux aquatiques.
Aussi, le Conseil général de la Loire a décidé en 2003 le lancement d’une étude d’opportunité pour la mise en œuvre d’un SAGE.
Le lancement d’une procédure SAGE est apparu nécessaire notamment concernant la répartition de l’eau en étiage, la qualité des eaux et l’eutrophisation, la gestion du fleuve Loire et de ses grands ouvrages, la prise en compte de l’eau dans la planification territoriale. La Commission Locale de l’Eau (CLE), en charge de l’élaboration du SAGE et rassemblant l’ensemble des acteurs de la gestion de l’eau et du développement territorial, a également été mise en place permettant une gouvernanc locale de l’eau.