Le programme de recherche "Eaux et Territoires" a été mis en place en 2006 par le Ministère de l’Ecologie du Développement durable, du Transport et du Logement (MEEDDTL), le CNRS et l'Irstea. Il ambitionne de mettre en relation les connaissances relatives au fonctionnement des hydrosystèmes et celles qui portent sur les territoires afin d’éclairer les politiques actuelles ou à venir portées par les acteurs publics responsables de la gestion des territoires et de la gestion de l’eau. Il s’agit de développer un regard critique sur la mise en œuvre des politiques publiques sectorielles du double point de vue de la gestion de l’eau et de la dynamique territoriale. Il s’inscrit en particulier dans le contexte de la mise en œuvre de la Directive Cadre sur l’Eau.
Le colloque final de ce programme s'est déroulé le 1er et 2 avril 2015 à Paris, et ce document se veut une retranscription fidèle des commentaires des intervenants.