Les réflexions pour engager un SAGE sur le bassin de l’Hers-Mort - Girou ont émergé dès 1999 au sein du Syndicat Mixte du Bassin Versant de l’Hers-Mort (SMBVH), aujourd'hui devenu le Syndicat du Bassin Hers-Girou (SBHG). Elles ont été relancées en 2007 à l’initiative du Conseil Général de la Haute Garonne et en concertation avec les services de l’Etat et de l’Agence de l’Eau Adour-Garonne. Le Conseil Général a réalisé le dossier de candidature du SAGE en 2010.
L’élaboration du SAGE s'est déroulée sur les années 2013 à 2017. Suite à la consultation des assemblées, à l'enquête publique et à la validation définitive de la Commission Locale de l'Eau sur le projet, le SAGE Hers Mort Girou a été approuvé par arrêté le 17 mai 2018. Les documents constitutifs sont disponibles sur Gest'eau.