Le bassin de l’Orain, d’une superficie de 239 km², est entièrement compris dans le département du Jura.

L'Orain prend sa source au pied des premiers contreforts jurassiens et du Revermont. D'une superficie de 239 Km2, son bassin versant présente une altitude comprise entre 600 et 190 m et est soumis à un climat semi-continentale. Il est arrosé en moyenne chaque année de 800 mm de pluie en plaine et 1400 mm sur le plateau. Sur sa partie amont, son cours torrentiel emprunte un paysage au relief marqué composé de roches marno-calcaires. Il rejoint ensuite le fossé bressan où prennent place des formations sablo-argileuses surmontées à l'aval d'alluvions récentes. L'Orain prend alors une allure de rivière de plaine dans un paysage au modelé plus doux avant de rejoindre la rivière Doubs sur sa rive gauche après un parcours de 40 Km.

En tête de bassin, l'Orain présente les caractériques hydrobiologiques d'un cours d'eau de la "zone à truite". Cette typologie évolue classiquement vers l'aval jusqu'à la "zone à barbeau". Son peuplement piscicole est particulièrement dégradé en lien avec des altérations de la qualité de l'eau et de la qualité physique et fonctionnelle des cours d'eau. Les travaux de redressement – recalibrage sur l’Orain et ses affluents ont en effet entraîné des dysfonctionnements morphodynamiques importants en particulier en matière d’incision du lit mineur. Le bilan sédimentaire fait apparaître ainsi un volume de 250 000 m³ de matériaux déficitaires en fond de lit suite à l’incision consécutive aux travaux. Ces altérations s'ajoutent aux dégradations de la qualité de l'eau liées à des dysfonctionnements persistants au niveau de l'assainissement domestique et industriel, et des pratiques agricoles. Elles constituent un enjeu majeur pour la reconquête de la qualité biologique de l'Orain et de ses affluents mais également en terme de gestion quantitative de la ressource en eau.

Altération physique, habitationnelle et morphodynamique du lit mineur des cours d'eau.

Reconquête du lit majeur, restauration des habitats aquatiques en lit mineur, restauration de la continuité écologique, développement de l'assainissement domestique, réduction des pollutions d'origines agricole et industrielle, gestion quantitative de la ressource en eau, sécurité des biens et des personnes vis à vis des inondations, information et sensibilisation des habitants du bassin versant

Le contrat de rivière Orain qui s'échelonnera sur la période 2011-2015 devrait permettre d'atteindre les objectifs de bon état chimique sur la totalité des masses d'eau superficielles dont l'échéance est prévue pour 2015.

En revanche, l'atteinte du bon état écologique apparait plus difficile dans la période impartie compte tenu de l'état de dégradation physique important de l'Orain. En effet, seuls des projets ambitieux de renaturation permettront cette atteinte du bon état. L'importante pression foncière présente sur le bassin versant rend la mise en œuvre de ces actions particulièrement complexe et longue.

Enfin, en ce qui concerne les masses d'eau dont l'échéance a été repoussée à 2021 et notamment la Grozonne qui apparait comme l'un des affluents les plus dégradés, des opérations complémentaires (essentiellement de restauration physique) seront très certainement nécessaires afin d'atteindre cet objectif. Au niveau du Bief d'Acle, la présence probable d'intrusions salines rendra difficile cette atteinte du bon état écologique et des actions devront être envisagées afin de les quantifier et de déterminer leur origine.

Affluent rive gauche du Doubs, l’Orain prend naissance au Sud-Est de la commune de Poligny. Son territoire, concernant majoritairement la plaine de Bresse, est bordé à l’Est par les premiers contreforts Jurassiens et le Revermont.

Les activités économiques dominantes sont représentées :

- au niveau agricole par l’élevage extensif de bovins à vocation laitière sur la partie amont du bassin versant et les polycultures sur la partie aval,

- au niveau industriel par la métallurgie, le traitement de surface et l’agroalimentaire.

Les activités forestières sont également bien représentées. En effet, le bassin versant de l’Orain est recouvert par près de 14 600 hectares de forêts à dominante feuillue, soit environ 42 % de sa superficie totale.

Le contrat de rivière ne concerne qu’un seul département, à savoir le Jura. Le bassin versant comprend 36 communes regroupées en 6 cantons. 4 communautés de communes et 1 communauté d'agglomération sont recensées sur le territoire : la Communauté de Communes du Comté de Grimont, la Communauté de Communes de la Plaine Jurassienne, la Communauté de Communes du Val d’Amour, la Communauté de Communes Arbois, Vignes et Villages – Pays de Louis Pasteur, et la Communauté d’agglomération du Grand Dole. Deux syndicats de rivière étaient présents historiquement sur le bassin mais sont en cours de dissolution ; les communautés de communes et d'agglomération reprenant progressivement la compétence de gestion des cours d'eau.

Le contrat a été signé le 27 septembre 2011.

IPSEAU, EAUX CONTINENTALES, SCIENCES ENVIRONNEMENT, HYDRATEC